La gestion des débits, principalement en période de crue reste un enjeu majeur sur ce bassin versant du fait d’une concentration de l’habitat et des activités en aval du cours d’eau, dans l’espace de zone inondable. La qualité des milieux est impactée par les disfonctionnements hydromorphologiques imputables aux ruissellements excessifs et à la modification du lit mineur (incision, artificialisation du lit, ouvrages faisant obstacle à la continuité,). En effet, les ruptures de continuité écologique, les secteurs anthropisés dégradent la qualité de ce cours d’eau.
Les problématiques de rejets des stations d’épurations génèrent aussi des impacts forts sur le milieu, et d’autant plus en période d’étiage.